Гиссаро-Алай — горная система в Центральной Азии, составная часть Памиро-Алая.
Основные горные хребты Гиссаро-Алая имеют широтное и субширотное простирание. Западную и среднюю части системы образуют Туркестанский, Зеравшанский и Гиссарский хребты и их отроги; восточную часть составляет Алайский хребет, который простирается от соединения с Ферганским хребтом до Матчинского горного узла. В западной части, на продолжении Туркестанского хребта и его отрога хребта Мальгузар, располагаются средневысотные хребты Нуратау, Актау и ряд низкогорных массивов на продолжении Зеравшанского хребта — так называемые Зирабулак-Зиаэтдинские горы. Высоты многих хребтов превышают 5000 м. В районе Матчинского горного узла высота достигает 5621 м, на стыке Зеравшанского и Алайского хребтов — 5301 м (пик Игла), немного восточнее — 5539 м (высшая точка Алайского хребта); в средней части Зеравшанского хребта — 5489 м (пик Чимтарга).